林羽点了点头，说道：“我们必须彻底摧毁这个基地，解救这些被囚禁的生物。”

就在他们准备展开行动时，一个身材高大、身着黑色长袍的人从基地深处走了出来。他的脸上戴着一个黑色的面具，看不清面容，但从他身上散发出来的强大气息可以感觉到，他就是这个黑暗组织的首领。

“你们以为这样就能轻易摧毁我们的组织吗？太天真了！” 黑暗组织首领的声音低沉而冰冷。

林羽毫不畏惧地盯着他，说道：“你的阴谋已经被我们识破，现在投降还来得及。”

黑暗组织首领发出一阵狂笑：“投降？你们根本不知道我们的计划有多么伟大。整个宇宙都将在我们的统治之下，而你们，只是我们前进道路上的绊脚石。”

说完，黑暗组织首领突然发动攻击，他的手中凝聚出一团黑色的能量球，向着林羽和队员们扔了过来。林羽迅速举起能量剑，将能量球劈成了两半。但能量球爆炸后产生的冲击波，还是将队员们震飞了出去。

林羽站起身来，眼中燃烧着愤怒的火焰：“既然你冥顽不灵，那就别怪我们不客气了。”

林羽和苏瑶带领着队员们再次向黑暗组织首领发起攻击。双方展开了一场惊心动魄的激战，能量的光芒在基地内闪烁，爆炸声震耳欲聋。在战斗中，林羽和苏瑶逐渐发现了黑暗组织首领的弱点，他们相互配合，不断地对他发起攻击。

最终，在林羽的一记致命攻击下，黑暗组织首领终于倒在了地上。随着他的倒下，黑暗组织的基地也开始发生剧烈的爆炸。林羽和队员们迅速解救出被囚禁的外星生物，然后撤离了基地。

当他们回到飞船上时，身后的基地已经被熊熊大火所吞噬。林羽和苏瑶望着那燃烧的基地，心中感慨万千。这场战斗虽然胜利了，但他们也付出了巨大的代价。

“我们成功摧毁了黑暗组织，宇宙新秩序终于可以得到保障了。” 苏瑶欣慰地说道。

林羽点了点头，说道：“没错，但我们不能放松警惕。宇宙中还有许多未知的危险和挑战等待着我们，我们必须继续努力，守护好宇宙的和平与安宁。”

说完，讨伐舰队缓缓升空，向着宇宙深处飞去。林羽和苏瑶又将踏上新的征程，为了宇宙的未来，继续奋斗……