菲利普一世的王位并不稳固：克利奥帕特拉·提亚（Cleopatra Thea）与她的儿子安条克十三世（Antiochus XIII，安条克十世之子），藏匿于叙利亚，等待重新夺回王位的机会。

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另一方面，安条克十二世（Antiochus XII）则取代了德米特里三世·尤卡鲁斯（Demetrius III Eucaerus）控制了大马士革（Damascus）。

不过，没有证据表明，安条克十二世想争夺安条克（Antioch）。

根据约瑟夫斯（Josephus）的记载，菲利普一世趁安条克十二世远征纳巴泰亚（Nabataea）之机，攻占了大马士革。

城市的总督迈列修斯（Milesius）为菲利普一世打开了城门，但没能得到新主人的应有回报，于是他等到菲利普一世离开城市后，又关闭了城门，将新国王锁在城外，直到安条克十二世归来。

在塞琉古王朝，针对竞争者（或篡位者）的战役所铸的货币上，国王的形象通常带有胡须。

安条克十二世在其统治的前两年没有胡须，但在公元前85/84年，出现了胡须，这可能与菲利普一世攻占大马士革有关。

不过，安条克十二世没有北上与兄弟作战，关于安条克十二世胡须与菲利普一世试图占领大马士革之间的联系这一假定缺乏证据。

没有发现菲利普一世在大马士革铸造的硬币，表明他对这座城市的占领时间很短。

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在对大马士革的攻击后，菲利普一世就从古代文献中消失。

尽管没有确凿证据，但大多数学者普遍认为菲利普一世死于公元前83年。

他可能被葬在塞琉西亚·皮埃里亚（Seleucia Pieria）的尼卡托雷翁（Nikatoreion）陵墓中。

传统上，大多数学者认为菲利普一世的继任者是亚美尼亚的提格兰二世（Tigranes II），尽管菲利普一世可能有一个年幼的儿子——菲利普二世（Philip II）。