公元前163年，托勒密八世反被驱逐，被迫撤退至昔兰尼（Cyrene）。

然而，当托勒密六世于公元前145年去世后，托勒密八世被邀请回到埃及执掌王位，并与其姐姐克利奥帕特拉二世结婚，这位姐姐同时也是托勒密六世的遗孀。

然而，托勒密八世与克利奥帕特拉二世之间的关系迅速恶化，特别是在托勒密八世娶了克利奥帕特拉三世（Cleopatra III）——即托勒密六世和克利奥帕特拉二世的女儿——作为第二任妻子后。

这一冲突最终导致内战，克利奥帕特拉二世在一方，而托勒密八世和克利奥帕特拉三世在另一方（公元前132年-公元前126年）。

托勒密八世和克利奥帕特拉三世取得胜利，但于公元前124年与克利奥帕特拉二世和解并恢复了她的共同摄政地位。

托勒密九世·索特（Ptolemy IX Soter）是托勒密八世和克利奥帕特拉三世的儿子。

他的确切出生日期不明。

起初，托勒密九世并非王位继承人——继承人是托勒密·孟菲斯（Ptolemy Memphites），即托勒密六世和克利奥帕特拉二世之子，与他年龄相仿。

在公元前134/3年，托勒密九世曾担任亚历山大大帝（Alexander the Great）的年度祭司，而托勒密·孟菲斯在前一年担任了同一职位。

然而，在公元前130年内战期间，克利奥帕特拉二世试图让托勒密·孟菲斯成为她的共治者，托勒密八世为此将托勒密·孟菲斯杀害，托勒密九世因此成为王位继承人。

大约在公元前117年，托勒密九世被派往塞浦路斯（Cyprus），据说是应其母的要求，在岛上担任总督。

在此之前不久，他与姐姐克利奥帕特拉四世（Cleopatra IV）结婚，她在塞浦路斯期间为他生下了两个儿子：未来的托勒密十二世（Ptolemy XII，公元前117年出生）和另一位未来的塞浦路斯国王托勒密（Ptolemy，约公元前116年出生）。

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116年6月28日，托勒密八世去世。