托勒密八世对昔兰尼加（Cyrenaica）并不满意，于公元前163年末或公元前162年初前往罗马请求帮助。

罗马元老院同意帮助裁定，宣称托勒密八世应当得到塞浦路斯（Cyprus）作为补偿。

元老院派出提图斯·曼利乌斯·托奎图斯（Titus Manlius Torquatus）和格奈乌斯·科尼利乌斯·梅鲁拉（Gnaeus Cornelius Merula）作为使节，迫使托勒密六世让步，但托勒密六世拖延并含糊其辞。

在公元前162年末回到罗马后，使节们说服元老院放弃与托勒密六世的联盟，并允许托勒密八世使用武力来控制塞浦路斯。

然而，元老院未提供任何实际支持，塞浦路斯仍在托勒密六世的掌控之下。

公元前162年，托勒密六世还参与了一个旨在破坏塞琉古王国的阴谋。

他的代理人在罗马协助国王的堂弟德米特里一世（Demetrius I）从囚禁中逃脱，返回叙利亚（Syria），以从未成年国王安条克五世手中夺取塞琉古帝国的控制权。

然而，一旦德米特里一世上台，他们的利益开始出现分歧，两国间战争的可能性再次浮现。

在公元前158年或154年，托勒密六世的塞浦路斯总督阿尔基亚斯（Archias）试图以500塔兰特的价格将该岛出售给德米特里一世，但他被发现并在计划实现之前上吊自杀。

公元前154年，托勒密八世在一次暗杀企图中幸存下来，并将此归咎于他的兄弟。

他再次向罗马元老院请求协助对抗托勒密六世。

元老院同意派出由格奈乌斯·科尼利乌斯·梅鲁拉（Gnaeus Cornelius Merula）和卢修斯·米努修斯·瑟尔默斯（Lucius Minucius Thermus）领导的第二个使团，并配备军队以强制将塞浦路斯转交给托勒密八世。

然而，托勒密六世在克里特联盟（Cretan League）的帮助下，围困了托勒密八世并在拉皮托斯（Lapethus）将他俘获。

他说服托勒密八世撤出塞浦路斯，以换取昔兰尼加的继续控制权、每年支付的粮食供给以及与他幼年女儿之一，可能是克利奥帕特拉·提亚（Cleopatra Thea）成年后结婚的承诺。

由于与兄弟的冲突，托勒密六世特别努力地推进长子托勒密·尤帕托（Ptolemy Eupator）作为继承人。

年轻的王子在公元前158年仅八岁时被任命为亚历山大和王室崇拜的祭司。