无数的人赶赴战场，交接奈克瑟斯的光芒，与无数的异生兽大军战斗。

光芒日益强大，最后进化为犹如神明般的诺亚的身姿，拯救了来访者的母星。

但是由于恐惧，来访者仿照诺亚制造出了对异生兽最终兵器，究极人造人扎基。

但是最后扎基在和异生兽的战斗中觉醒了扭曲的自我，成为了黑暗破坏神，黑暗扎基。想要超越光之巨人，证明身为仿造品的自己存在意义的它放任甚至带领异生兽破坏一切。

来访者最终将自己的星球化为超新星爆炸，企图与异生兽和黑暗扎基同归于尽。

扎基和在来访者母星沉睡的诺亚一起来到了光之国主宇宙，经过一番交战后在诺亚最终的发动下再次回到N计划宇宙。

来访者来到了地球，人类将其发现并回收。

第二年，在漂亮国某牧场最先出现零号异生兽，但因其并不强大而很快被消灭。

来访者向人类传达异生兽即将出现的消息并愿意提供科技对付异生兽。

相信来访者预言的一派借助联合国的力量秘密成立了TLT，并启动普罗米修斯计划，以唯一能与来访者沟通的超能力者——海本隼人和各个优秀的超能力者的DNA结合，培养出出色的人造人的计划。

全世界各地的科学家对异生兽进行研究后发现来访者所说的一切属实。

一名名叫西条波的博士试图研究对异生兽抗体，但却在研究取得突破性进展时被附身在她的得意门生山冈一的黑暗扎基杀死。黑暗扎基在西条波博士的女儿西条凪的心里种下仇恨的种子。

因为早已知晓R7因子存在的扎基预言奈克瑟斯的光芒总有一天会传递到西条凪手中。

之后普罗米计划的产物几乎都没有和来访者沟通的能力。

唯独最成功的吉良择优可以。

吉良择优甚至在the one和奈克斯特来到地球前就预言了那场事件，并画了下来。

之后，蓝色光球和红色光球相继来到地球，各自和一名人类结合。

两者经过进化后，在新宿展开决战。